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Su carrera como técnico comenzó en el 2007, siendo asistente del Deportivo Pereira. Luego, en el 2008, acompañó a Santiago Escobar en el Independiente Medellín, obteniendo el sub-título del torneo finalización.
A pesar de la clasificación a la Copa Libertadores, los malos resultados precipitaron la salida del ‘Sachi’, reemplazado por Álvarez en el banquillo técnico del ‘poderoso’.
Leonel Álvarez comenzó su carrera en el Independiente Medellín en 1983. En Colombia jugó con el América de Cali, Atlético Nacional, Deportivo Pereira y Deportes Quindío. En el ámbito internacional, Álvarez fichó con clubes como el Veracruz de México, Real Valladolid de España, el Dallas Burn y New England Revolution de la MLS.
Obtuvo un campeonato colombiano (1992) con el cuadro escarlata y fue campeón de la Copa Libertadores con el verde antioqueño en 1989 frente al Olimpia del Paraguay.
Leonel Álvarez marcó el gol en la tanda de penales con el que los antioqueños se coronaron campeones del torneo surcontinental.
Álvarez también firmó con la Major League Soccer antes de la temporada inicial de 1996, siendo asignado al equipo Dallas Burn. En su primer año con el equipo, Álvarez demostró claramente sus cualidades, con tres goles marcados y cinco pases que terminaron en gol.
Desafortunadamente para el Burn, Álvarez fue trasladado a México en 1997, donde jugó para el Veracruz. No regresó hasta 1998, cuando rápidamente recuperó su posición inicial; Leonel se convertiría en un jugador extremadamente importante para el medio campo del Burn por los siguientes dos años,
No obstante, el mediocampista colombiano fue vendido al New England Revolution en 1999. Jugaría para el Revolution durante todo el 2001, siempre como titular, antes de que el equipo decidiera no renovar su contrato para la temporada 2002.
Leonel Álvarez jugó un total de 101 partidos con la selección colombiana. Hizo su debut el 14 de febrero de 1985 ante Polonia. Fue jugador mundialista en Italia (1990) y Estados Unidos (1994), apareciendo en un total de siete partidos. Adicionalmente, jugó la Copa América con la selección colombiana en 1987, 1989, 1991, 1993, y 1995.