IBM pone a disposición la tecnología para combatir el coronavirus

El sistema fue diseñado para reducir el tiempo y el costo de los ensayos clínicos, centralizando y organizando los datos, brindando acceso 24/7, a la información de los ensayos, a través de una única URL, que puede ser accedida desde cualquier dispositivo con internet, y brindando una plataforma de administración de datos flexible y escalable.

El software de IBM se ofreció por primera vez a las autoridades de salud chinas, y con la propagación de la enfermedad, la compañía ahora lo pone a disposición de forma gratuita para una red más amplia de agencias nacionales de salud.

Dicha compañía estadounidense ha vendido este producto durante varios años a sitios de investigación clínica y organizaciones que participan en ensayos clínicos patrocinados por compañías farmacéuticas y biotecnológicas -que pueden ser sistemas de salud, hospitales académicos, grandes consultorios médicos o investigadores individuales-, por su trabajo en el seguimiento de ensayos clínicos.

Durante este período crítico, la empresa tiene la intención de trabajar junto con instituciones médicas y profesionales usando el sistema IBM Clinical Development (ICD) para acelerar el desarrollo de medicamentos clave para combatir el virus. ICD es una solución unificada de captura de datos basada en SaaS -Software as a Service-, diseñada para proporcionar visibilidad de punta a punta, así como capacidades de gestión de pacientes,localizaciones y ensayos clínicos.

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ICD está diseñado para reducir el tiempo y el costo de los ensayos clínicos al centralizar y organizar los detalles de los ensayos clínicos, brindando acceso 24/7, a los datos de los ensayos a través de una única URL desde cualquier dispositivo con internet, y brindando una plataforma de administración de datos flexible y escalable para ayuda a diseñar y administrar ensayos clínicos incorporando características y servicios opcionales específicos para estos ensayos.

Apoyo de EE.UU.para ayudar la lucha contra el COVID-19

La tecnología ha estado en el centro de los avances científicos durante décadas. Hace apenas 16 años, la supercomputadora Blue Gene de IBM debutó como la primera supercomputadora en romper la barrera “petascale” y pasó a desempeñar un papel crítico en la secuenciación del genoma humano.

Ese avance ayudó a abrir la puerta a nuevos fármacos y tratamientos, y Blue Gene pasó a simular aproximadamente el uno por ciento de una corteza cerebral humana, que contiene 1.600 millones de neuronas con aproximadamente 9 billones de conexiones, lo que llevó a una mayor comprensión de la computadora más compleja jamás creada: el cerebro humano.

Pero algunos problemas requieren una respuesta más inmediata, y es por eso que el Departamento de Energía de los Estados Unidos anunció un nuevo y poderoso aliado en la lucha contra la epidemia COVID-19 que ha arrasado 84 países, y todos los continentes excepto la Antártida  según el último resumen de los CDC: el superordenador Summit construido por IBM.

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Los virus infectan las células uniéndose a ellas y usando una "aguja" para inyectar su material genético en la célula huésped. Al tratar de entender nuevos compuestos biológicos, como los virus, los investigadores de los laboratorios húmedos crecen el microorganismo y ven cómo reacciona en la vida real a la introducción de nuevos compuestos, pero esto puede ser un proceso lento sin computadoras capaces de realizar simulaciones para reducir el rango de variables potenciales, pero incluso entonces hay desafíos.  

Las simulaciones por computadoras pueden examinar cómo reaccionan las diferentes variables con diferentes virus, pero cuando cada una de estas variables individuales está compuesta por millones o incluso miles de millones de datos únicos y con la necesidad de ejecutar múltiples simulaciones, esto puede convertirse rápidamente en un proceso que consume mucho tiempo utilizando hardware básico.

Utilizando Summit, los investigadores fueron capaces de simular 8.000 compuestos en cuestión de días para modelar que podrían afectar ese proceso de infección al pico del virus, y han identificado 77 compuestos de moléculas pequeñas, como medicamentos y compuestos naturales, que han demostrado el potencial de afectar la capacidad de COVID-19 para acoplar e infectar las células huésped.

"Se necesitaba una cumbre para obtener rápidamente los resultados de simulación que necesitábamos. Nos llevó uno o dos días, mientras que habría tomado meses en una computadora normal", dijo Jeremy Smith, Governor´s Chair de la Universidad de Tennessee, director del Centro UT/ORNL para biofísica molecular e investigador principal en el estudio. "Nuestros resultados no significan que hayamos encontrado una cura o tratamiento para el coronavirus.

Estamos muy esperanzados, que nuestros hallazgos computacionales informarán estudios futuros y proporcionarán un marco que los experimentalistas utilizarán para investigar más a fondo estos compuestos. Sólo entonces sabremos si alguno de ellos exhibe las características necesarias para mitigar este virus".

Summit dio a los investigadores su enorme capacidad de procesamiento de datos, habilitada por sus 4.608 nodos de servidor IBM Power Systems AC922, cada uno equipado con dos CPU IBM POWER9 y seis GPU NVIDIA Tensorcore V100, lo que le da un rendimiento máximo de 200 petaflops, diseñados para ser más potentes que un millón de portátiles de gama alta.

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Desde que debutó como la supercomputadora más poderosa del mundo en 2018,ha cimentado su título impulsando investigaciones pioneras para ayudar a entender los orígenes del universo, ayudando a entender la crisis de los opioides,y  mostrando cómo los humanos serían capaces de aterrizar en Marte.